Цветок вечности: Дни Камогавы

После событий первого сезона прошло некоторое время. Ёко занимается подводными исследованиями у побережья Мадагаскара. Мадока, утратившая способность активировать «глаз ауры», возвращается в Камогаву. Дома она находит письма от Лан и Мугинами. В них подруги рассказывают о своей текущей жизни и поздравляют Мадоку с Новым Годом. Спустя несколько месяцев завершается очередной учебный год. Мадока переходит в следующий класс, и приближается её день рождения.

В это же время лучшие подруги Мадоки отправляются в межгалактический туристический центр на планете Полигидрон. Их цель — осмотреть копию города Камогавы, воссозданную в этом центре. Дальнейшие события развиваются вокруг этих двух линий: повседневной жизни Мадоки в родном городе и визита её подруг в космическую достопримечательность.