Главный герой по имени Ура работает в мире, где человеческая цивилизация находится на грани исчезновения. Окружающая среда представляет собой техногенные руины, простирающиеся до горизонта. Природные ландшафты полностью исчезли, уступив место искусственным конструкциям. Ура занимается восстановлением старых земных архивов, что является одним из немногих видов деятельности, продолжающихся в этих условиях. В процессе работы Ура обнаруживает необычную запись. По мере восстановления её содержания

В конце 1990-х годов в Японии происходит серия самоубийств с необычными совпадениями. Все жертвы погибают, прыгая с крыши заброшенного здания Фудзё. Девушка по имени Сики Рёги, обладающая сверхъестественными способностями, подозревает, что эти события имеют мистическую природу. Она начинает расследование вместе с Тоуко Аодзаки — детективом, специализирующимся на магии и изготовлении кукол, а также с её помощником Микией Кокотоу. В ходе расследования Сики сталкивается с загадочными явлениями и

Зимой 1995 года Микия Кокуто встречает молодую женщину во время ночной прогулки по снегу. Шики Рёги, одетая в белое кимоно и обладающая загадочным взглядом, улыбается Микии, который с любопытством смотрит на неё. Весной того же года Микия замечает Шики на церемонии поступления в старшую школу, и они становятся знакомыми через разговоры во время обеда. По мере того как Шики начинает раскрываться перед ним, Микия узнаёт о её необычном воспитании. В то же время в городе Мифунэ происходит серия

Сики Рёги провела два года в коме после автомобильной аварии. Проснувшись, она обнаружила у себя амнезию. К ней обращается Токо Аодзаки — владелица детективного агентства «Храм Пустоты» и практикующая волшебница. Из-за утраты второй личности Сики лишилась не только связанных с ней воспоминаний, но и ощущения реальности. Она перестала чувствовать себя живой и воспринимает собственное тело как пустую оболочку. На Сики начинают нападать загадочные существа, которые пытаются установить контроль над

Сики Рёги встречает юношу по имени Томоэ Эндзё. Томоэ утверждает, что сбежал из дома после убийства собственной матери. Сики позволяет Томоэ временно остаться в своей квартире. С этого момента между ними начинается совместное проживание. В определённый момент Томоэ встречает свою мать, которую ранее считал убитой. После этой встречи Томоэ и Сики отправляются в его старую квартиру в Огава-Комплексе, чтобы выяснить реальное положение дел. Там Сики сталкивается с могущественным магом по имени

Младшая сестра Микии Кокуто, Адзака, обучается магии под руководством наставницы Токо Аодзаки. Адзака получает задание провести расследование в женской академии Рэйэн, где она сама учится. В академии произошла серия инцидентов - у нескольких учениц были похищены воспоминания. По имеющимся данным, воздействие оказывали невидимые существа, называемые феями. Для выполнения задания Адзаке требуется помощь Сики Рёги, обладающей особым зрением, позволяющим видеть этих существ. Сики Рёги соглашается