В секретной лаборатории группа учёных занимается воссозданием редких и вымерших покемонов с помощью генной инженерии. Для этого используется анализ ДНК. В результате одного из экспериментов был создан Мьюту, генетический материал для которого взяли у легендарного покемона Мью. Проект держится в тайне, а его цели и возможные последствия остаются неясными. В это же время тренеры покемонов Эш, Мисти и Брок получают приглашение на боевой турнир. Участникам предстоит сражаться со своими покемонами,