Главный герой Иори Китахара поступает в колледж, расположенный в приморском городе Идзу-Сити. Он снимает комнату в доме семьи Котэгава, которая владеет магазином снаряжения для дайвинга «Grand Blue». Иори испытывает страх перед водой и не планирует заниматься морскими видами деятельности. После знакомства с местной группой дайверов герой постепенно пересматривает свое отношение к морю. Он предпринимает попытки преодолеть фобию и освоить подводное плавание. Сюжет строится вокруг процесса