Индекс волшебства: Чудо Эндимиона

В Академия-Сити завершено строительство космического подъёмника «Эндимион». Главный герой Тома Камидзё и его подруга Индекс случайно встречают эспера нулевого уровня Арису Мэйго. «Ассоциация магов» преследует Арису по неизвестным причинам и совершает нападение на Академия-Сити.

Для защиты города от угрозы формируется движение сопротивления под руководством Шатауры Секвенции. Позднее от Стэйла Магнуса главные герои узнают, что Арису могут использовать как инструмент для разжигания конфликта между миром Магии и миром Науки.