Врата Штейна: Зона загрузки дежавю

События фильма происходят через год после завершения сериала. Ринтаро Окабэ испытывает трудности с адаптацией к реальности из-за навязчивых воспоминаний о созданных им временных линиях. Он постоянно анализирует свои прошлые решения и ошибки, что постепенно ухудшает его психическое состояние и связь с окружающим миром.

Курису Макисэ возвращается в Японию после года отсутствия. Она испытывает повторяющееся чувство дежавю, которое указывает на реальность существования Окабэ. Этот феномен становится для неё источником беспокойства и мотивацией для поиска способа вернуть его. Результат её попыток и возможные последствия в виде временных парадоксов раскрываются в полнометражной версии «Врат Штейна».