Группа персонажей, включая Уорнса, Райера и других членов экипажа "Гнезда наблюдателей", использует технологию пространственно-временного перемещения под названием "Проект Исход", чтобы покинуть Землю. Мисаки Курэха, присутствовавшая во время финальной битвы с противником, известным как "Гуль", не присоединяется к ним. В этот момент на её глазах Земля претерпевает трансформацию и оказывается изолированной временным барьером. Райер и остальные пытаются найти способ
Спустя два года после завершения войны между Земным Альянсом и Координаторами установилось временное равновесие. Это положение не устраивает обе стороны конфликта. Группа Координаторов решает возобновить боевые действия и направляет колонию Юниус 7 к Земле. Целью является уничтожение большей части населения планеты. Силы ZAFT успевают взорвать колонию, но её осколки падают на поверхность Земли и наносят значительные разрушения. В результате падения обломков война возобновляется с новой силой.
На планете Ла-Метал, находящейся в состоянии замерзания, королева приняла решение о замене тел жителей на механические аналоги. Это было сделано для обеспечения выживания населения в условиях гибели планеты. Однако процедура привела к утрате человеческого разума у всех, кто прошел механизацию. Королева Ла Андромеда Прометия II, ставшая бездушным роботом, решила распространить механизацию на все человечество. Ее дочери, Мэйтэл и Эмеральда, наблюдая за последствиями использования искусственных
Главная героиня Ноно — девушка из сельской местности. Она мечтает стать пилотом космического корабля, подобно героине популярного сериала Нонорин. После случайной встречи с пилотом по имени Ларк Ноно присоединяется к организации «Братство». Члены этой группы управляют большими боевыми роботами и сражаются с роем космических монстров. Ларк демонстрирует уверенность и смелость в бою. Ноно воспринимает Ларк как старшую сестру и равняется на неё. Она считает, что благодаря напарнику в лице
В 26 веке Рион Штайнер приходит в себя в больнице и слышит в своей голове голос девушки. Он не помнит, кто он такой, и использует психические способности, чтобы выбраться. Рион отправляется на поиски своего прошлого и пытается выяснить правду о тех, кто его преследует — галерианах. За галерианами стоит суперкомпьютер Дороти, обладающий комплексом бога. Рион владеет единственным ключом к программе, способной уничтожить Дороти. Его путешествие связано с раскрытием тайн собственной личности и
Хироюки Фудзита и Акари Камигиси учатся в двенадцатом классе. Они и их друзья постепенно взрослеют — как физически, так и умственно. Однако среди них отсутствует один из их лучших друзей — реалистичный андроид по имени Мульти. Неожиданно для всех Мульти вновь доставляют в кампус без предварительного уведомления. Однако возвращённый андроид отличается от прежней версии, которую они знали ранее. Это изменение становится ключевым фактором в дальнейшем развитии событий.