Воины-марионетки от Джей до Икс

События развиваются через несколько месяцев после окончания предыдущей OVA-серии. Главный герой Отару Мамия продолжает взаимодействовать с группой девушек-марионеток, которые обладают самосознанием. Антагонист Гельхардт фон Фауст возвращается и возобновляет эксперименты с технологией марионеток, выходящей за пределы допустимых норм. Девушки-марионетки оказываются перед выбором между привязанностью к Отару и запрограммированной преданностью Фаусту.

Основной конфликт строится вокруг попыток Отару, Лайм, Черри и Бладберри противостоять планам Фауста. Исход противостояния определяет, сохранят ли марионетки свою автономию или будут возвращены к изначальным функциям. Сюжетная линия фокусируется на последствиях технологических экспериментов и взаимоотношениях между людьми и искусственными существами.