Команда учёных-ниндзя Гатчамен II

Спустя два года после восстановления мира на Земле Сосай Икс вновь заявляет о себе. Он топит круизный лайнер "Куин Маргарет", похищает выжившую четырехлетнюю девочку Сэмми Доктор Пандора и принудительно превращает её в Джельсадору - очередного генерала Галлактора. Синдикат восстанавливает силы и начинает захватывать военных и научных специалистов. В ответ ИСО возрождает свою первую линию обороны - Кагаку Ниндзятай.

Ситуация осложняется тем, что Кондор Дзё пропал без вести и считается погибшим. Команда, даже получив новое оружие и транспортные средства, оказывается в замешательстве. Доктор Кодзабуро Намбу усугубляет положение, привлекая к работе нового G-2 по имени Гетц Ястреб.