Ханако, призрак с внеклассными историями

Среди учеников школы Камомэ ходят слухи о том, что одна из семи школьных тайн, призрак Ханако-кун, обзавелся помощницей. Этой помощницей стала первокурсница старшей школы Нэнэ Ясиро. Вместе Ханако и Ясиро занимаются расследованием различных сверхъестественных явлений, происходящих в школе. Их деятельность направлена на поддержание равновесия между миром людей и миром духов.

В свободное от расследований время персонажи часто проводят время вместе, занимаясь различными повседневными делами. В ходе этих занятий они взаимодействуют с одноклассниками Ясиро и сталкиваются с призрачными сущностями, которые невидимы для обычных людей. Эти существа постоянно находятся на территории школы и влияют на происходящие там события.