С начала, если...

Сюжет разворачивается в альтернативной временной линии по отношению к событиям аниме «С начала. Часть II». Персонаж Нэму погибает. Главный герой Дзюнъити пытается пережить эту утрату и вернуться к обычной жизни. В этот период он начинает больше времени проводить с Котори, которая проявляет к нему внимание и поддержку. Отношения между Дзюнъити и Котори постепенно развиваются на фоне его попыток справиться с горем.

Основное внимание уделяется внутреннему состоянию Дзюнъити и его взаимодействию с окружающими. Герой сталкивается с необходимостью принять произошедшее и найти новые смыслы в повседневности. Котори играет роль человека, который помогает ему в этом процессе. Дальнейшее развитие событий зависит от того, сможет ли Дзюнъити отпустить прошлое и построить новые отношения. Интрига заключается в том, как изменится его характер и решения под влиянием этих обстоятельств.