Космический воин Зеро

После продолжительной войны между человечеством и расой разумных машин, называемых механоидами, было заключено перемирие. К тому моменту механоиды расширили своё влияние во Вселенной, и Земля практически перешла под их контроль. Адмирал флота человечества Зеро, участвовавший в Великой Галактической войне, после её окончания служит капитаном буксирного судна. Несмотря на потерю всей семьи в ходе конфликта, он продолжает выполнять задачи по защите Земли.

Во время одного из рейсов на буксирном судне Зеро подвергается атаке неизвестного пиратского корабля, известного как «Тень смерти». Вступив в бой, Зеро терпит поражение. Позднее командование поручает ему новую миссию — захватить легендарного пирата капитана Харлока, который, как выясняется, и был нападавшим. Под флагом Независимого Флота, на бывшем военном линкоре «Кария», с командой из людей и механоидов, Зеро отправляется на поиски Харлока по всей Вселенной.